(二)要與新型農村合作醫療建設相結合。在農村地區，藥品安全直接關係到千家萬戶，關係到每個村民的身體健康和生命安全，關係到農村社會的穩定，因此，加強農村醫療機構的監管就要積極協調和爭取當地新農合管委會的支持，加強對新農合定點醫療單位的監管和規範，從村級新農合定點醫療機構的“三室”分離、房屋設施、藥械貯存條件、藥劑人員的上崗培訓、藥品購進驗收和貯存保管記錄等方面，制訂相應的管理制度和標準，對符合要求和標準的可以當地新農合管委會、食品藥品監管部門之名頒發“新農合規範藥房”牌匾，從根本上達到強化和規範新農合定點醫療機構軟、硬體設施建設的目的，近而為農村老百姓創造安全、放心的用藥環境。
(三)要與農村藥品監督網路與供應網路建設相結合。農村藥品“兩網”建設的目的是最大限度地保證農村藥品質量和滿足農民用藥安全、有效，是提高農村廣大民眾生活質量的重要手斷，是為農民辦實事、做好事。因此，要加強對農村醫療機構的監管就要積極推進農村藥品“兩網”建設，著實解決老百姓買藥難、買不上放心藥問題。一要加強監督網路建設。不僅重視事後的監督查處，更要重視事先的監督管理。充分發揮農村藥品協管員與信息員的積極性、主動性，及時發現查處農村醫療機構的藥品違法違規行為。利用協管站發展來帶動信息站建設，達到各級醫療機構相互制約，相互促進的良性發展趨勢。二要提高供應網路管理。針對目前存在的配送不及時、藥價高等問題，提高對配送中心的監管力度，使農村藥品供應網路延伸到每一個涉藥單位，使藥品供應價格明顯下降，以規範購貨渠道，保證藥械質量，保障農村公共安全。
(四)要與“規範化”藥房建設相結合。對於農村醫療機構使用藥品醫療器械存在的問題，還應該從藥房管理本身入手，將規範化藥房延伸到村屯，依據“分類指導、以點帶面、整體推進”的原則，逐步提高農村醫療機構管理水平。對於各項設施、設備齊全，各項制度健全，各項管理規範的衛生所授予《規範化藥房》牌匾，對未評上“規範藥房”的農村醫療機構，採取通報、新聞媒體曝光、限期整改、重點檢查等方法，提高其規範管理的自覺性。同時，對“規範化藥房”實施跟蹤管理，每年年底組織復驗，復驗合格的保留稱號，不合格的取消稱號以此達到農村醫療機構合理用藥用械的自律意識，提升藥學服務的安全意識。
農村醫療機構的監管工作任務十分繁重和艱巨，責任更是重大，只有全面實踐科學監管理念，按照“創新監管、注重長效、找準薄弱環節、加大監管力度”的總體工作思路，才能不斷開創農村醫療機構監管新局面，構建社會主義和諧社會。