2、管理體制不順，管理力量薄弱。
民辦學校的管理體制不順，包括教育行政部門與勞動、物價、稅務等部門之間和教育行政部門內部之間的管理體制不夠順暢，職責不夠明確，導致多頭審批、政出多門、各自為政、管理混亂，或管得太死，限制了民辦學校的發展，或又過於放任自流，導致少數民辦學校的辦學質量得不到保證，敗壞了民辦學校的的聲譽。管力量相對薄弱，管理責任不夠落實，目前，教育行政部門對民辦教育的管理力量除少數地區稍強一些外，大部分地區的管理力量都相對比較薄弱。
3、政策措施不配套。
國家提出對民辦教育是：積極鼓勵、大力支持、正確引導、加強管理”，但真正有一定力度的扶持政策措施不多，對民辦教育重視不夠、鼓勵支持不夠。特別是土地、物價、審計、勞動、人事、保險等部門和行業之間缺少應有的配合；對民辦學校的設定和管理等仍沿用公辦學校的標準和管理模式；在社會力量辦學的招生、教師的聘用、辦學用地等也不能與公辦學校享受同等的待遇，不能體現公平競爭的原則；民辦學校的收費標準也是多年一貫制，不能體現市場運行機制的作用；還有的一些地方缺少政策的穩定性和連續性，直接影響到民辦學校的生存與發展。
4、法制不夠健全，執法意識不強。
國務院《社會力量辦學條例》己發布並施行，對民辦教育發展作了充分肯定。但《條例》還比較原則，可操作性還不夠強，《民辦教育法》也還遲遲不能出台．許多民辦教育的舉辦者，辦學思想不夠端正，依法辦學的觀念和意識淡薄，學校的內部管理體制還未形成一套比較成熟的、規範的、科學的管理制度，個別學校存在領導班子不團結、制度不健全、管理不嚴格、教育教學質量不高等問題，有的甚至出現非法辦學行為。
5、對民辦學校產生的負面影響缺少限制措施。
民辦學校既有適應市場經濟而充滿活力的一面，也有受不規範市場影響而陷入困境出現混亂的一面，還有市場經濟本身也有一個不完善和內在具有不可調和矛盾的問題，如，用經濟規律代替教育規律，不按教育規律開展教育教學活動，忽視民辦教育作為教育事業的一部分所具有的公益性原則；市場經濟活動中的某些謀求利潤最大化原則、拜金主義、本位主義、盲目性和短期行為等已反映到民辦教育中，在一定程度上也損害了教育事業的社會形象；還有公辦學校民營化，也可能會降低來自貧窮家庭孩子的入學機會，擴大社會的不平等。如何來限制這些負面影響關係到民辦教育的健康發展。
四、民辦教育改革與發展的對策
根據我省民辦教育發展現狀和存在的問題，展望民辦教育發展未來，我們對民辦教育的改革與發展提出如下對策：
1、政府領導和社會各界要解放思想，提高民辦教育對經濟發展和社會進步重要作用的認識，確立民辦教育在整個教育事業中的地位。針對目前社會對民辦教育認識的各種誤區，政府和社會各界要解放思想，用“十五大”精神和鄧小平理論來指導我們的工作，要根據世界教育發展方向研究我國在實現社會主義市場經濟體制過程中民辦教育改革與發展問題，充分認識發展民辦教育對推進教育體制改革和辦學體制改革的作用，用正確的發展觀對待民辦教育發展過程中存在的問題，經常深入民辦學校調查，切實幫助解決實際困難和存在的問題，促進民辦教育事業的蓬勃發展。