曹操統一北方後，撫程昱背而說：“兗州之敗，不用君言，吾何以至此”(《三國志·魏書·程昱傳》)？
建安十六年(211年)，以驍將馬超、韓遂為首的十部聯軍，聚集10餘萬人馬，據守潼關抗曹。曹操親率大軍出征，留程昱輔佐曹丕。建安十七年(212年)正月，河間人田銀、蘇伯煽動幽州、冀州的民眾起事，引起州郡震恐。曹丕派遣將軍賈信率軍前往討伐。賈信殲滅了田銀、蘇伯的大部力量，還有1000餘人被包圍，請求投降。按照曹操親自訂立的“圍而後降者不赦”的軍令，將被全部處斬。程昱建議說：“誅降者，謂在擾攘之時，天下雲起，故圍而後降者不赦，以示威天下，開其利路，使不至於圍也。今天下略定，且在邦域之中，此必降之賊，殺之無所威懼，非前日誅降之意。臣以為不可誅也；縱誅之，宜先啟聞。”眾人說：“軍事有專，無請。”曹丕對程昱說：“君有所不盡邪？”程昱說：“凡專命者，謂有臨時之急，呼吸之間者耳。今此賊制在賈信之手，無朝夕之變。故老臣不願將軍行之也”(裴松之注《三國志·魏書·程昱傳》)。曹丕同意，報請曹操處理，曹操果然赦免了這批人的死罪。曹操回軍後，對程昱說：“君非徒明于軍計，又善處人父子之間”(裴松之注《三國志·魏書·程昱傳》)。
後程昱對宗人說：“知足不辱，吾可以退矣”(《三國志·魏書·程昱傳》)。於是自表歸兵，從此閉門不出。
程昱性格剛戾，常與人意見相佐。有人告其謀反，但曹操反而待其更為優厚。曹丕稱帝後，程昱為衛尉進封安鄉侯，增邑三百戶，前後總計八百戶。封幼子程延及孫程曉為列侯。當準備封其為為三公時，程昱不幸去世。曹丕為之流淚，追贈程昱為車騎將軍，謚肅侯，子程武嗣。
點評：程昱有膽有謀，知足不辱，得以全身而退。《三國志·魏書·程昱傳》評價程昱時說：“才策謀略，世之奇士，雖清治德業，殊於荀攸，而籌畫所料，是其倫也。”