二、當前農民專業合作社發展的困難和問題
兩年的實踐證明，農民專業合作社在提高農民生產經營組織化程度，提升農業產業化水平，增加農民收入等方面發揮了積極的作用。但是，在調研中我們也發現了諸如合作社隊伍和規模偏小、運作模式不成熟、影響力不大、競爭力不強等問題。農民專業合作社規範化建設水平總體上不高，一家一戶的小農生產方式仍然是主要的生產模式。尤其是大部分合作社雖然註冊登記了，但內部規章制度不健全；多數農民專業合作社只能提供簡單的技術服務，沒有真正把農民組織起來等，很難有效地為農民提供服務，起到示範帶動作用；農村具有合法主體資格的農民專業合作社，總體上呈現小、散、弱的特徵。存在這些問題的原因主要有以下方面：
1、對這種新型合作經濟組織認識不到位。主要表現在：有關部門對農民專業合作社的政策及法規，宣傳不到位，導致農民對相關優惠扶持政策不了解，有的只是聽說如果領到合作社的營業執照及相關手續就可以貸款，或者為向上級爭取項目、資金增加一個硬體條件，反正辦合作社執照手續簡單又不收取費用，就有了辦一個放著，說不定能用得上的心理。調研中發現，註冊登記的收購類和農機服務類合作社大多數為這種情況；有的鄉鎮把成立農民專業合作社當成任務下放到各個村，完全不考慮當地的實際情況，盲目的大搞一氣，更談不上“民辦、民管、民受益”，導致所建的合作社有名無實、形同虛設；有的農戶不懂什麼是農民專業合作社，對合作社的重要性和必要性知之甚少，加之我國的合作化運動曾走過彎路，一些農民對加入農村專業合作經濟組織心存疑意，積極性不高；有的農民專業經濟組織已經具備了合作社的規模和形式，但由於農民對國家的優惠政策認識不夠，沒有註冊登記農民合作社這一經濟實體的意識，更沒有通過合作社這一合法形式規範經營、提高抵禦風險能力的意識。
2、合作社內部制度不健全。農民專業合作社組建與公司組建及運作不同，農民專業合作社無論是在註冊、運行過程中，還是國家在促進其發展中，都有一定的管理彈性，尤其是農民專業合作社成員以農民為主體，對建立制度無疑是一個難題。正是由於此才造成一些合作社發展不規範，管理機制不健全，內部運行機制不夠完善，工作的隨意性較大。
3、缺少人才、技術、信息帶頭人。農民專業合作社以成員為主要服務對象，提供產前、產中、產後的技術、信息、生產資料購買和農產品的銷售、加工、運輸、貯藏等服務。這就要求農民專業合作社組織者必須具有獲取信息的渠道和提供技術的能力。但我旗目前的情況是：農民有迫切改善現狀的渴望，於是自發組織起來進行了登記，但是在登記的過程中就會發現，有的連表格的填寫都有困難，我們只能幫助其填寫，有的甚至對農民專業合作社政策根本不了解，這也就造成了在運行過程中，諸如缺乏農民專業合作社的專業知識，缺乏有實踐經驗和市場知識的帶頭人等問題的存在。二是合作社的產品多為初級產品，沒有專業化的技術設備，導致生產的產品科技含量不高，進入市場的機會也相對較低。
4、各部門之間缺乏信息溝通。雖然為農民專業合作社服務的相關部門都陸續出台了一些優惠政策，但只是停留在自己部門的工作操作中，各部門之間的信息不能互通，結果49戶合作社中就有42戶是從事種植、養殖。