按照《關於加強全國礦產資源潛力評價與儲量利用調查組織管理工作的通知》(國土資發[xx]193號)和《關於印發全國礦產資源潛力評價與儲量利用調查組織管理職責分工方案的通知》(國土資廳發[xx]180號)的要求，全國礦業權實地核查工作由部礦產開發管理司負責，中國地質調查局發展研究中心提供技術支撐，按照部礦產開發管理司要求開展工作。為便於工作開展，部礦產開發管理司會同中國地質調查局發展研究中心等單位成立統一機構，負責全國礦業權實地核查的組織實施工作。
(一)全國組織機構
1.全國礦業權實地核查項目辦公室
負責全國礦業權實地核查工作的日常事務管理和技術業務管理。下設全國礦業權實地核查技術管理部和專家顧問組。
主 任：劉連和 礦產開發管理司司長
副主任：王宗亞 礦產開發管理司副司長(正局級)
譚永傑 中國地質調查局發展研究中心總工
成 員：王 陶 礦產開發管理司綜合處處長
金愉中 礦產開發管理司非金屬礦產管理處處長
劉 忠 礦產開發管理司金屬礦產管理處處長
夏木清 礦產開發管理司煤炭礦產管理處處長
王全明 中國地質調查局資源評價部處長
付晶澤 中國地質調查局發展研究中心處長
胡斌華 礦產開發管理司綜合處主任科員
2.全國礦業權實地核查技術管理部
設在中國地質調查局發展研究中心，承辦全國礦業權實地核查項目組織實施工作。具體負責落實全國礦業權實地核查工作組部署的各項工作，負責全國實地核查成果的匯總和綜合工作，負責省級實地核查成果的檢查驗收，負責礦業權實地核查承擔單位的技術培訓和指導，協調、督促各省實地核查工作。人員組成如下：
負責人：付晶澤王陶(開發司)
副負責人：楊建鋒、李景朝、康高峰(航測局)
下設綜合組、技術組、數據組和政策組。
綜合組：負責全國礦業權實地核查協調、聯繫、宣傳、財務與資料存檔工作。