依照法律、行政法規規定代扣、代收稅款，是法律賦予扣繳義務人的一項法定義務，並且不以其意志為轉移。反之，對法律、法規中沒有規定負有代扣、代收稅款義務的單位和個人，稅務機關就不得強行要求其代扣、代收稅款。根據《稅務登記管理辦法》、《稅收征管法》及其實施細則的規定，扣繳義務人的主要義務及其法律責任包括：
1.應當依法辦理扣繳登記
扣繳義務人（國家機關除外）應當自扣繳義務發生之日起30日內，向當地主管稅務機關申請辦理扣繳稅款登記，並向稅務機關領取扣繳稅款登記證，以作為扣繳稅款的合法、有效證件。對扣繳義務人自身已辦理了稅務登記的，可不再另行發給扣繳稅款登記證。扣繳義務人未按規定辦理扣繳登記的，稅務機關應當自發現之日起3日內責令限期改正，並可處2000元以下的罰款。
2.應當設定代扣、代收賬簿
扣繳義務人應當自稅收法律、行政法規規定的扣繳義務發生之日起10日內，按照所代扣、代收的稅種，分別設定代扣代繳、代收代繳稅款賬簿（能夠通過計算機正確、完整計算代扣代繳、代收代繳稅款情況的，其計算機輸出的完整的書面會計記錄，可視同會計賬簿）。對不按規定設定、保管賬簿、記賬憑證及有關資料的，由稅務機關責令限期改正，可以處二千元以下的罰款，情節嚴重的，處二千元以上五千元以下的罰款。
3.應當依法全面代扣、代收稅款
扣繳義務人應扣而未扣、應收而未收稅款的，對扣繳義務人處應扣未扣、應收未收稅款百分之五十以上三倍以下的罰款。對應扣未扣、應收未收的稅款，根據《國家稅務總局關於貫徹〈中華人民共和國稅收徵收管理法〉及其實施細則若干具體問題的通知》（國稅發［2003］47號）規定：“應當責成扣繳義務人限期將應扣未扣、應收未收的稅款補扣或補收。”
4.應當按時申報
扣繳義務人必須按照法律、行政法規規定或稅務機關依法確定的申報期限、申報內容如實報送代扣代繳、代收代繳稅款報告表以及稅務機關根據實際需要報送的其他有關資料。
扣繳義務人未按時申報的，稅務機關可責令限期改正，同時可處以二千元以下的罰款，情節嚴重的，可以處二千元以上一萬元以下的罰款。扣繳義務人編造虛假計稅依據的，由稅務機關責令限期改正，並處五萬元以下的罰款。
5.應當按時解繳稅款
扣繳義務人對已代扣、代收的稅款（扣繳義務人書面承諾代納稅人支付稅款的，也應當認定扣繳義務人已扣、已收稅款），必須按照法律、行政法規規定或稅務機關依法確定的期限內解繳稅款。對扣繳義務人已扣已收稅款在規定的期限內未繳或少繳的，應視不同情況作不同的責任追究：（1）扣繳義務人對已扣稅款已進行了納稅申報但不繳或少繳的屬欠稅。對其欠稅由稅務機關責令限期繳納（最長期限不得超過15日），在寬限期內仍未繳納的，稅務機關除依法強制追繳稅款、滯納金外，還可以處不繳或少繳稅款百分之五十以上五倍以下的罰款。
（2）扣繳義務人採取了偽造、變造、隱匿、擅自銷毀賬簿、記賬憑證或經稅務機關通知申報（對依法辦理了扣繳登記的扣繳義務人未按時申報的，視同“經稅務機關通知申報”）而拒不申報或進行虛假納稅申報等手段形成不繳或少繳稅款的，由稅務機關追繳其不繳或少繳的稅款、滯納金，還應當並處不繳或少繳稅款百分之五十以上五倍以下的罰款。構成犯罪的，依法追究刑事責任。
（3）扣繳義務人以暴力、威脅方法拒不繳納已扣、已收稅款的，屬抗稅。除由稅務機關依法追繳稅款、滯納金外，對構成犯罪的，還應以抗稅罪定罪處罰；對情節輕微，未構成犯罪的，由稅務機關追繳其拒繳的稅款、滯納金，並處拒繳稅款一倍以上五倍以下的罰款。
（4）扣繳義務人採取轉移、隱匿手段，妨礙稅務機關對其不繳或少繳稅款的追繳，稅務機關除依法追繳其不繳或少繳稅款、滯納金外，並處不繳或少繳稅款百分之五十以上五倍以下的罰款。
6.應當依法接受稅務檢查
扣繳義務人對稅務機關的依法檢查應當接受。對扣繳義務人逃避、拒絕或以其他方式阻撓稅務機關檢查以及扣繳義務人提供虛假資料，不如實反映情況，或拒絕提供有關資料；拒絕或阻止稅務機關記錄、錄音、錄像、照相和複製與案件有關的情況和資料的；在檢查期間，扣繳義務人轉移、隱匿、銷毀有關資料的和不依法接受稅務檢查的其他情形的，由稅務機關責令限期改正，同時，可處以一萬元以下的罰款，情節嚴重的，還可處一萬元以上五萬元以下的罰款。
從事生產、經營的扣繳義務人有上述違法行為，且拒不接受稅務機關處理的，稅務機關可以收繳其發票或停止向其發售發票。