第七，黨員管理約束不夠嚴謹。黨員應該服從黨的綱領，遵守黨的章程，履行黨員義務，執行黨的決定，嚴守黨的秘密。現實工作生活中，由於機關支部對黨員缺乏行之有效的嚴格約束和管理，黨支部負責人和支委各成員沒有完全認真履行對黨員的管理職責，從而造成黨員履行黨員義務、執行黨的決定、遵守黨的紀律、嚴守黨的秘密等方面形成了一定的偏差，出現了一些問題，這些言行表現在對社會民眾的行政工作交往中，或多或少地產生了黨員乃至機關的不良影響。
第八，黨員監督不夠紮實有效。根據《黨內監督工作條例》和《黨內監督制度》，機關黨組織應該建立公平公正、公開透明的監督機制，黨組織應加強對所屬黨員的行為監督，廣大黨員更應該加強對黨組織班子集體特別是主要負責人的監督，形成縱橫交錯、上下有序的民主和諧監督體系。然而現實中機關支部多數仍舊停留在自上而下的監督機制，甚至有的黨員片面認為監督別人是自找麻煩、惹禍上身等等，有的認為多一事不如少一事，乾脆不履行監督職責，沒有形成大的負面影響就任其不管，監督意識不強，監督效果很不明顯。
第九，黨費收繳使用不夠平衡。機關黨員的黨費按基數比例規定收繳上解後，許多支部甚至很多黨員強烈要求上級配發電教設備或訂購學習書報。按照黨章中黨費收繳使用有關規定，目前用在機關黨員培訓教育方面的經費投入仍顯不足。在信息化迅速發展的今天，更需要配置起光碟機和多媒體計算機等現代化設備為廣大機關黨員提供更為先進、更為便利的教育學習條件，激勵機關支部抓黨建工作的積極性和主動性，促進機關黨建工作。在目前農村黨員黨費收繳標準極低、黨建陣地投入配套基本到位的情況下，應該高度重視和及時研究解決機關黨建的部分經費投入問題。
第十，黨建工作缺乏創新特色。機關黨建工作多年來一成不變，缺乏新穎靈活的機制和載體創新機關建工作，使得機關黨建工作缺乏特色和亮點，機關黨組織沒有認真研究新形勢下加強和推動黨建工作的新措施、新辦法，因而機關黨建工作顯得格調單一、缺乏活力。
(三)機關黨建工作的問題成因
第一，支部領導重視不夠到位。部分機關支部書記認為黨建工作軟指標、軟考核，沒有實在具體的東西可抓。特別是機關單位主要負責同志兼任支部書記的，認為業務工作是核心，忽視了以黨建促業務的重要性，沒有系統認真地研究黨建工作和業務工作的結合點，沒有準確把握黨建工作在機關各項工作中的重要位置。一部分副職領導兼任機關支部書記的，往往認為黨建工作靠“一把手”抓，沒有對黨建工作深入研究和建言獻策，沒有在推動機關黨建工作方面下功夫、用心思。機關中的黨務幹部一成多年不變，沒有及時調整或提拔重用的黨務幹部有想法、有抱怨，工作上被動應付、消極對待，部分新調整的黨務幹部對黨建工作不熟悉，也有隨機應付的現象。
第二，一般黨員認識不夠到位。機關黨員習慣在行政制度管理下工作生活，對黨支部的管理和機關黨的建設存在認識上的偏差，有的黨員同志認為黨建工作是形式主義，有的認為黨內管理教育多此一舉，更有的黨員思想意識形態上根本不存在機關黨組織觀念，對黨組織生活不參加，不主動服從組織分配的工作，不按照按要求交納黨費，不學習黨的基本理論知識，不按照黨員的行為規範要求自己，實際上形成與黨組織對黨員的標準要求有一定的差距，是思想認識不深刻、不到位所造成的。
第三，管理制度執行不夠到位。機關黨建制定了許多切實可行的工作制度，但多數支部沒有嚴格執行這些制度而使黨建制度流於形式的現象是造成黨建工作成效不明顯的主要癥結所在。這種問題的存在與支部班子的整體認識有關，與支部主要領導或組織委員沒有完全認真履行職責更有關。特別是一些支部不嚴格執行民主評議黨員制度、不堅持“三會一課”制度、不履行黨內監督工作制度，在機關黨員的考核、獎懲、提拔、任免、處分等問題上不向黨委勾通匯報，甚至出現以黨組意見代替黨委意見的現象，從而造成有違規定、有違程式的事情常有發生，給機關黨的工作帶來很大的危害。
第四，督促檢查落實不夠到位。黨建工作主要依靠督促檢查抓工作落實，而督促檢查的主體是機關黨委和黨支部的主要負責人，督促檢查的對象是各支部所開展的各項黨建工作。由於機關支部數量較多，機關黨建事務繁多，機關黨委人員較少，督促檢查力量不足，從而在一定程度上弱化了對機關支部工作的督查，機關支部書記對黨委安排的黨建工作也僅停留在圈閱批示轉辦檔案的形式中抓落實，對具體工作開展情況過問督查也不是十分到位。因而機關黨建容易形成重安排部署，輕督查落實的不協調局面。
第五，職能作用發揮不夠到位。機關黨組織的職能較多，但每項職能的發揮情況卻不是很理想。有的機關支部沒有認真宣傳黨的路線方針政策，有的支部沒有很好地組織機關黨員進行學習教育，有的支部沒有主動做好黨員的思想政治工作，有的支部對機關統戰工作、婦聯工作和青年工作不問不管，有的機關支部常年不向黨委(黨組)匯報工作。由於部分機關支部職能不履行、發揮作用不充分，導致機關黨建工作沒有太大的起色。