管理系統的建立和運作。一個現代企業制度既包括“產權清晰”，也包括“管理科學”。而管理科學則在於有一套科學的管理系統，逐步從人治走向法治。在國有企業改制過程當中，我們常常把更多的注意力集中在產權關係等問題上，而改制後，很多企業出現問題的原因是在經營管理方面出現了失誤。我們也看到，許多國企即使改制比較完善，但管理沒有跟上，仍然導致企業經營績效不佳。主要有以下幾個方面的問題或現象：企業領導決策的隨意性，沒有科學的決策程式；市場意識淡薄，客戶服務意識差；戰略研究很少，公司運作限於事務和“救火”；組織結構未實現扁平化，不是以客戶為導向、流程為基礎；職能不健全，戰略、信息、人力資源、研發、財務等功能欠缺；科技投入少，產品更新換代慢，競爭力弱；人才匱乏，人力資源管理停留在勞資管理上而不是人力資源開發；財務管理觀念落後，財務管理停留在會計記帳上而不是公司理財；財務管理混亂，內部控制體系漏洞百出，成本費用控制不力；行銷定位不明確、行銷功能僅限於“關係銷售”而不是“品牌行銷”；客戶管理幾乎空白，基本信息都不能統一管理，業務員大量帶走客戶；信息管理落後，計算機使用水平低，電子商務的理解僅限於建個網頁……國有企業產權改革並不必意味著企業的成功，能否成功還與管理等多種要素相聯繫。
改制涉及的幾大難點主要體現在企業制度層面、經營層面和管理層面。改制企業普遍存在資金匱乏、資產狀況極差、債務沉重、產品沒有市場等等問題，對他們來說,最大的問題還是生存的問題，當務之急就是要採取各種措施，如節約挖潛、大力開拓市場，儘快扭轉不利的經營狀況，為順利開展全面的系統變革贏得時間和機會。
中國國有企業改革的實質，是解除兩個“無限責任”：一個是解除“國家對企業承擔的無限責任”，就是企業改制；一個是解除“企業對職工的無限責任”，就是進行職工身份轉換。推進國有企業的改革和發展，必須堅持建立社會主義市場經濟體制的改革目標，適應國內外經濟、科技和市場的發展變化，進一步深化改革，擴大開放，不斷增強企業市場競爭能力、科技創新能力和抗禦風險能力。要堅持公有制經濟為主體、多種所有制經濟共同發展的基本經濟制度，堅持鄧小平同志提出的“三個有利於”的根本標準，積極探索在社會主義市場經濟條件下發展國有企業的新路子，大膽探索能夠極大
促進生產力發展的公有制實現形式，使國有經濟在改革中不斷獲取新的生機和活力。