工傷認定案件在行政訴訟案件中占的比例相對較大，當事人之間的矛盾大，協調難，占用了大量的審判資源，從近幾年工傷認定行政訴訟案件特點、原因等方面進行分析，進而對減少該類糾紛的發生提出相關建議。
一、工傷認定行政糾紛的主要特點
1、農民工是受工傷傷害的主要人群。農民工是申請工傷認定的主體，由於他們的知識水平相對較低，大多數只能從事建築、製造等體力工作，而這些行業正是工傷事故和職業病多發的行業。此外，由於他們的法律意識相對薄弱，與企業相比處於弱勢地位，很少與企業簽訂勞動契約，一旦發生工傷事故企業極易藉故推卸責任從而引發糾紛。
2、“三工一勞”中，工作原因是影響工傷認定的焦點問題。“三工”是指在工作時間和工作場所，由於工作原因受到的事故傷害，是否符合“三工”要求是判斷職工所受傷害是否為工傷的一個重要標準。工傷認定中，工作時間和工作場所相對固定，容易判斷，工作原因問題成為當事人雙方及工傷認定機關爭議的焦點。判斷是否因工產生，除了現場勘察等依據外，證人證言是一個重要的證據，但是工傷認定中的證人多為企業職工，與企業有著千絲萬縷的聯繫，故許多人拒絕作證甚至做偽證。一些證人即使在工傷認定機關調查時做了相關證明，一旦進入訴訟程式，往往當庭推翻以前所做證明，導致工傷認定困難。
3、提起工傷認定行政訴訟的一方多為用人單位，但撤訴率較高。對於沒有為職工辦理工傷保險的企業，一旦勞動部門認定工傷成立，其將支付數額不菲的醫療費、誤工費等各種費用。企業往往通過提起訴訟的方式惡意拖延賠付時間，並為日後在與受害人的調解中占據優勢地位創造條件。如果工傷認定的行政訴訟採用判決方式結案，多數情況下企業將必須賠付各種費用，而第三人要想拿到這筆費用則通常要經過一審、二審等各種程式，延長了其接受賠償的時間。故工傷認定案件中，作為原告的企業與作為第三人的受害人都願意在法院的主持下進行調解，雙方各讓一步達成調解協定，案件的撤訴略較高。
二、造成工傷認定行政糾紛的現實原因
(一)企業方面的原因
1、企業違法成本低，責任缺失，漠視職工的人身安全。我國的工傷保險屬於強制險，勞動者自己不繳納工傷保險費，由用人單位負責繳納。對於不按法律規定繳納工傷險的單位，除要求其按規定繳納相關的工傷保險費用外，處罰方式僅僅是對主管人員和直接責任人員處以1萬元以下的罰款，這種處罰方式導致企業不參加工傷保險的違法成本較低，責任缺失，寧願冒著被處罰的風險也不願主動繳納保險費用。
2、部分中小企業基於成本的壓力怠於為職工辦理工傷保險。近幾年，中小企業以其投資少，操作靈活等優勢得到迅猛發展，成為地區經濟成長的重要推進力量。但是由於其規模小，資金鍊不牢固，中小企業的資金壓力相對較大，而目前的工傷險繳納方式是在社會保險中同醫療、養老等保險費用一同繳納，月繳納數額為職工月工資的40%，其中企業要負擔30%，因此一個月收入3000元的工人，企業若要為其繳納工傷保險費用就必須為其繳納包括醫療、養老等保險費用在內的總計900元的社會保險費用，較高的數額使得一些中小企業往往對於工傷保險費用的繳納心有餘而力不足。