1、整體規模分散。民營企業多數為中小企業，規模過小，較為分散。據XX年底的統計數字，私營企業共176.18萬戶，平均每戶註冊資本卻只有75.5萬元，僱工數僅11.4人。絕大部分民營企業分布在一般加工業、運輸業、簡單的服務、貿易領域，企業規模小，設備和工藝落後，產品檔次低；雖說便於發揮民營企業靈活機動的優勢，但也存在許多弊端。首先是形不成經濟規模，生產成本居高不下，管理落後，技術水平得不到提到，在很大程度上影響了企業的整體效益。其次是企業規模小，市場占有率低，很難同大企業進行產品競爭，往往在大企業的競爭實力面前敗下陣來，許多民營企業只能在市場的夾縫中艱難生存，有不少的民營企業因此倒閉。再是受實力所限，很難在高新技術領域搶占先機，許多都是在技術水平低的產業從事經營活動的，從事商業貿易的多，就地做生意的多，經營管理粗放型的多，單一產品的多，與同類企業爭原料，搶資源，拼市場，在傳統產業領域參與殘酷的競爭。從這些年的情況可以看出來，外國公司進入中國，並不期望在短期內即獲利，而是先把競爭對手打掉，然後占領市常他們會用低價的辦法來把很多國內企業衝垮，會發動很強大的廣告攻勢占領市場，企業小就很容易被吃掉。
２、企業管理欠科學。民營企業在發展初期，憑創辦者個人的管理能力和親屬的幫助基本上能促進企業的發展，但當企業發展到一定的階段和規模後，其家族式管理方式和有限的管理能力明顯滯後於企業進一步發展所需，少數企業因此使其生產經營陷入了困境。管理的欠科學，實質是管理人才的匱乏。據不完全統計，我市民營企業擁有中專以上學歷的職員3000餘人，大約占其就業職工總數的0.25%，有中高級職稱的管理人員就更少了。目前，多數民營企業還沒有形成一個以經營者為核心，以一批高智商、高水平、高素質管理人才為輔助的決策層和智囊層。導致企業發展過程中經營者的管理能力捉襟見肘，投資決策失誤時有發生。財務制度不健全，據調查，有60%的企業沒有建帳或建帳不準確、完整，財務管理混亂，漏洞較多，財務監督失效，難以進行成本核算管理。民營企業對mba的需求非常高。可惜的是，中國的mba學生很缺乏道德訓練，不忠於企業的人比比皆是，民營企業覺得還是自己人可靠，因此家族治理的非常多。有一個調查，民營企業主要的決策都是由老闆或它的家人做的，拿到正規董事會討論的還不到5％。這樣的治理結構，管理上當然容易出偏差。
３、技術水平不高。大多數民營企業起步水平不高，是從個體戶和專業戶中成長起來、分化出來的，大多以勞動密集型產業為主，生產裝備
、生產方式、產品技術含量都處在低水平，相當數量的民營企業仍然是手工勞動或半機械化操作，以現代生產方式開發高精尖產品的民營企業仍是鳳毛麟角。民營企業大多缺乏核心技術，甚至於沒有核心技術，不論傳統企業，還是高新技術產業，都是如此。企業科研開發能力薄弱，技術創新步伐緩慢，擁有自主智慧財產權的企業很少，多數企業仍處在模仿他人產品的階段，低水平重複投資嚴重，承接國有大型企業退下來的陳舊設備和轉移的落後技術，很難在高利潤的生產領域謀得一席之地，難以占領高端產品市場，後勁不足。雖然這幾年高科技型的民營企業在發展，但總體來看，還差得很遠，自己沒有研發力量。任何企業在開發一個新產品，需要做大量研究，要投入很多錢，而民營企業的研發基金明顯不夠。民營企業要有危機感，現在之所以還有一定的競爭力，是因為勞動力成本低。將來如果出現生產規模更大、成本更低或者產品更好的國外企業，民營企業沒有相應的技術水平肯定會束手就擒。