1、"三邊"市場已基本退出歷史舞台。
河邊、路邊、牆邊的"三邊"市場曾是北京市農副產品市場的主要部分。1990年城近郊區的473個集貿市場中，只有21個是廳室化的，占4.4%，而簡陋棚台式的馬路市場391個，占到82.7%，還有61個沒有任何設施，在打地攤經營。同時還有數以萬計的零散游商在沿街叫賣。1995年市區的690個有證集貿市場中有500多個是"三邊"市場，另外還有100多個無證的馬路市場。如此眾多的"三邊"市場雖然在一定時期內滿足了市民的購買需求，但其對城市環境、交通的危害很大。1995年開始，市政府提出了從撤銷255條主要大街的占路市場開始，逐步實行"三邊"市場的退路進廳。截至XX年8月底，全市共撤銷各類"三邊"市場720個，城區基本實現占路市場，遠郊區縣除了個別區縣外都實現了縣城地區無占路市場。三邊市場占農副產品市場主要部分的格局已經完全結束。
歷年撤銷占路市場情況表
年度1996199719981999XX合計
撤市數量109161126214110720
2、城區內的大型批發市場逐漸萎縮。
北京市農副產品市場歷來有"六大批發市場"的說法，它們是豐臺區新發地市場、岳各莊市場、海淀區大鐘寺市場、朝陽區太陽宮市場、水碓子市場和崇文區左安門市場。六大批發市場占據了全市市場蔬菜批發量的90%。但近年來，由於城市環境整治力度的加強和城市交通限制的施行，四環路內的批發市場在交易額和交易量上都受到了影響。朝陽區水碓子市場由於占路和占河道在1999年被撤銷。該市場歷年成交額都在億元以上，1998年農副產品交易額達到5.3億元。市場調研報告由於交通的原因，貨車進入三環路受到了限制，二環路旁的左安門市場農產品成交額由1997年的4億元一直跌到1999年的1.74億元。該市場的經營方式由批發變為了批零兼營，零售為主。岳各莊市場、大鐘寺市場、太陽宮市場也都受到了不同程度的影響。隨著外環公路的建成，交通限制的加強，預計四環路內的批發市場都將逐步退出以批發為主的經營模式。
3、設施檔次較高的農副產品市場逐漸增多。
近年來政府大力推進市場的升級改造工程。市場調研報告工商部門帶領部分市場主辦單位的負責人到福州、浙江等地進行考察，學習好的市場管理和建設模式。考察結束後各市場紛紛加大了升級改造的力度，僅1999年一年就有96個市場進行了升級改造，累計投資達1.18億元，改造市場面積85422平方米。其中，石景山區京西批發市場投資1000萬餘元填平了市場的"大坑"，新建3個交易大廳；海淀區大鐘寺批發市場投資300萬元改建水產交易大廳；豐臺區岳各莊市場投資100萬元改造路面和垃圾處理設施等。一些大型農副產品批發市場過去設施簡陋的狀況有所改觀。
廳棚式、樓廈式等設施檔次較高的市場明顯增多。1999年工商和商委共同制定了《北京市城區菜市場建設標準》，明確了市場建築和設施標準。目前新建農副產品市場一般為鋼混結構，拱形頂形式成為市場建築的主流。宣武區安順成市場、椿樹園市場、東城區新興里市場、朝陽區平樂園市場等一批農副產品市場的設施檔次都比較高，其內部經營環境寬敞、簡樸，徹底改變了原來農副產品市場髒亂差臭的狀況。