二是受利益調整以及傳統觀念的影響，一方面為解決下崗失業人員就業再就業問題，農民工的就業大都在苦髒累險等下崗失業人員不願從事的行業、工種。另一方面農民工的勞動所得卻常常被企業主或包工頭惡意拖欠、過度剝奪，合法權益得不到有效的保護。政府的政策導向更多的傾向於保護市民利益，而農民工帶來的公共衛生乃至社會治安方面的問題，則被過分的誇大，其貢獻在城裡的“主流社會”中也被邊緣化了。實際上仍然分割的城鄉勞動力市場和身份的歧視，大大降低了農民工可能獲得的勞動收入，同時也提高了其在城市的生活成本。就業環境和城市勞動力市場狀況，越來越成為農村剩餘勞動力“出得去”“留得下”的社會障礙。
三是轉移大批農村剩餘勞動力，是推動工業化進而帶動城市化的過程。而工業化的發展，需要有較高素質的勞動者。調查顯示，我市農村剩餘勞動力中，文盲的比重為9%，具有國小和國中文化的占80%左右。從絕對水平來看，農村剩餘勞動力以國小文化為主，其次是國中文化。從已經進入城市的農民工來看，大都是在簡單較重、技術含量不高的崗位上務工，其中以體力勞動為多，他們的職業技能，絕大多數是在上崗後邊乾邊取得的。這種文化水平和職業技能參與工業化進程，難度是不難想見的，這也是農村剩餘勞動力轉移的自身障礙。
2、農民工權益的保護問題。
隨著農村勞務輸出人員的大量增加，各種違反勞動法律法規、侵犯進城農民工合法權益的事件屢有發生，拖欠工資、不簽訂勞動契約、不繳納各類保險基金、加班加點、勞動條件及工作環境差，缺乏安全生產防範措施、勞保福利待遇低等問題日益突出。我們要充分認識維護進城農民工合法權益不受損害的重要性，切實增強抓好這項工作的緊迫感，努力發揮各相關職能部門的作用，認真分析、研究工作路數、納入工作日程，切實抓緊、抓好，全面提高我市農村勞務經濟的質量，進一步鞏固和發展我市勞務輸出成果，促進農村經濟發展，維護社會穩定。
3、信息網路不暢是影響農村勞動力轉移輸出的現實障礙。
一方面我市一部分鄉鎮沒有上網的的條件，與市勞動力信息網路不能實現信息共享，無法實現信息的有效溝通，影響勞務輸出工作的深入開展，另一方面，全國性乃至境外的勞務輸出基地網路還沒有建立起來，使我們的勞動力資源得不到有效地利用，不能充分利用國際、國內兩個市場開展工作，也使我們的勞務輸出工作有局限性。
4、組織化輸出比重小，依靠品牌占市場能力弱。從我市勞務輸出的規模和形成看，勞務輸出工作還處於起步發展階段，因此在勞務輸出的規模上，盲目和自發的外出務工人員和小規模的輸出占整個輸出人員的比重還比較大，組織化程度比較低，季節性輸出人數較多，常年性輸出人數較少。我市的勞務輸出品牌還不成規模，依靠品牌占領市場的能力還比較弱，據了解，目前除了雙陽的“境外勞務”、榆樹的“北京保全”在外具有一定影響外，其它的勞務輸出還限於一般性勞務輸出狀況，沒有形成自己的品牌特色，缺乏占領市場的優勢和能力。