根據農村稅費第二步改革的任務和內容，今後一段時間，我地區農村稅費改革要做好以下幾個方面的重點工作：
第一，嚴格執行稅費改革政策。中央決定XX年新疆全面取消農業特產稅，農業稅稅率降低一個百分點，即正稅由4％降到3％，附加按正稅的20％徵收，正附稅合計為3．6％，牧業稅與農業稅同步同比例降低。為確保政策落實到位，一要繼續推行農業稅收納稅申報制度，加大征管力度，做到依法治稅、依率計征、據實徵收，確保稅收足額徵繳入庫；二要對現有的農業稅計稅土地面積及納稅農戶，重新核實登記，並將農業稅徵收、減免數額核定到戶，以村組為單位張榜公布；三要嚴格執行自治區統一的農業稅政策，農業特產稅改徵農業稅後的計稅價格、計稅稅率。常年產量要執行自治區的統一標準；四要正確理解完成任務和執行政策之間的關係，堅持任務必須服從政策，對於符合減免稅條件的農戶，儘可能做到先減後征，體現黨的政策。
第二，建立規範的財政轉移支付制度。一是要界定轉移支付的責任，明確轉移支付的事項、標準和範圍，保證及時分配到位轉移支付資金。二是健全轉移支付制度，規範轉移支付辦法，加強對轉移支付資金監管的力度。三是嚴格按照自治區稅費改革財政專項轉移支付資金管理辦法規定的範圍安排資金。四是對村級組織的補助資金繼續實行“鄉管村用”，村級轉移支付資金主要用於村組幹部的報酬補貼、辦公經費、五保戶供養三項經常性開支。五是加強對轉移支付資金使用的監督管理。
第三，積極推進鄉鎮機構改革，確保基層政權有效運轉。推進鄉鎮機構改革，轉變鄉鎮政府職能是農村稅費改革成敗的關鍵。全地區要在確保“兩個保護”(即：保護農民的積極性和基層幹部的積極性)和“三個有利於”(即：有利於吐魯番穩定，有利於為老百姓辦事，有利於社會事業的發展)的基礎上，積極穩步推進。一是建立精幹高效的運行機制。鄉鎮行政編制在現有的基礎上堅決不能突破，對全地區鄉鎮機構在職幹部按實有人員實行總額控制，今後五年內不再增編，力爭減少財政供養人員，堅決清理超編人員和靠收費供養的人員。對鄉鎮機構未經批准擅自新增的人員財政不安排人員經費。同時，以積極慎重的態度，按程式有組織的進行鄉鎮合併、撤鄉並村以及保留村委會撤銷村民小組的工作。二是綜合設定鄉鎮事業單位機構，建立健全農村社會化服務體系，成立綜合性的“農業服務中心”、“文化服務中心”等。實行限額設定，一、二類鄉鎮限額不超過7個，三類鄉鎮不超過5個。三是大力壓縮財政撥款事業編制和人員。鄉鎮財政撥款事業單位人員編制的精簡幅度不得低於新黨發［XX］16號檔案確定的10％的要求。四是做好人員定崗分流工作。確保在5年的時間內完成人員分流安置工作。五是確立事業單位法人地位，增強事業單位活力。
第四，積極推進農村義務教育體制改革，促進農村教育事業發展。一是進一步鞏固完善“以縣為主”的農村義務教育辦學體制，強化縣級政府對農村義務教育的統籌管理責任。二是加大中國小布局調整，最佳化教育資源，擴大辦學規模，大力推進民漢合校、民民合校，建立以鄉鎮中心學校為主的農村學校管理體制。力爭農村中國小數量減少5％左右。三是今年年底前，全部撤銷鄉鎮教育辦公室，四是推進人事制度改革，合理核定鄉村教師編制，大力壓縮工勤人員，建立優勝劣汰機制，實行校長競聘上崗，教師資格準入制度，嚴格把好教師隊伍增人口子，積極引導、鼓勵城鎮教師到鄉村和邊遠地區學校任教。五是建立和完善以政府投入為主的農村義務教育經費保障機制，合理安排農村中國小公用經費、危房改造經費和寄宿制學生生活補助費，同時，確保稅費改革後農村義務教育投入不低於改革前的總體水平。