為規範研究工作，在組建研究組織機構的同時，制定了《新六藝課題研究組織機構設定意見》、《新六藝課題管理制度》、《新六藝子課題核心研究組管理意見》等一系列制度。形成了比較健全的研究工作制度系統，保證了研究工作規範有序進行。
(三)研究隊伍培訓工作
為提高研究人員的研究水平，總課題組先後組織了一系列的培訓活動。如總課題組先後於xx年9月、xx年11月和xx年年4月組織了三次新詩教骨幹教師培訓。xx年9月總課題組組織了城區國小體育教師武術套路培訓。總課題組於xx年9月組織了各核心研究組全體人員集中培訓。各校也結合本校實際，開展了一系列的培訓活動，如：城三校在近幾年內先後組織了五次書法教師沙龍活動;組織了詩詞知識講座、人品教育講座等多種培訓活動。又如城六校組織了學校課題組人員培訓;城二校組織了書法、繪畫等多次講座。
(四)開展研究活動
各類課題組根據研究進程，採取集中研討與分工合作的方式開展研究活動。特別是各子課題核心研究組，根據總課題組的統一部署，定期集中研究。每次研討活動，都有目的，有內容，有記錄。每次集中活動，做好下階段布置下階段的研究任務，確定下次集中的時間和地點。總課題組負責人和核心組指導教師都儘量參與各組的集中活動，到場進行具體指導。
研究期間，既開展了課標、教材的研製，還組織了兩屆新六藝教研系列活動。第一屆系列活動由總課題組直接組織開展。第二屆系列活動由總課題組統一部署，由子課題核心研究組具體組織開展。系列教研活動開展內容有新六藝課程試教，課堂教學競賽，論文、教案評選，詩歌習作評選，書法比賽和作品展覽等等。兩屆活動總計上競賽課55節，評選出論文、教案、活動方案總計284篇。評選教師詩歌231篇。
為提高新六藝教材的質量，總課題組組織了一系列集中指導，幫助各核心研究組對教材進行反覆修改。教管中心抽調學校幹部和骨幹教師，與教管中心教研員組成教材總編組，對教材進行修改和編排。為方便教師教學，還將新六藝課程全套教材製作成了電子課件。
(五)開展教育活動
研究期間，圍繞新六藝校本課程，開展課題教學實踐，並組織了大量教育主題活動。
各校或使用自編教學資料，或使用核心課題組編寫的教材開展新六藝校本課程教學。如城五校每周有3至4天下午在全校開設新樂教校本課程一節課;城三校全校各班每周開設一節書法課;二校也利用中午或下午開設書法課和繪畫課。除開展課堂教學嘗試外，有的學校還組織新六藝主題教育月活動，每月圍繞一門課程開展活動。各校還結合本校實際，開展了藝術節、科技節、體育節、廣場文藝演出等多種大型活動。
總課題組和核心研究組還集中組織了兩屆城區國小新六藝教育系列活動。
第一屆新六藝教育系列活動圍繞以“弘揚和培育民族精神”為主題，開展了八項活動，分別為：城區小學生詩歌吟誦會，詩歌習作評選，第七屆書畫展，禮儀佇列評比，“民族精神記在心”主題報告會。城區國小第一屆新樂教音樂會，城區小學生第一屆尚武大賽，以及“中華之光、領先世界”為主題的涪陵城區小學生科普徵文評選等。
第二屆新六藝教育系列活動以“學周波，迎奧運;為家鄉添彩，為祖國增輝”為主題，開展了城區小學生詩歌朗誦會、詩歌習作評選;城區小學生第八屆書畫展覽和現場書畫比賽;城區小學生新禮教學生徵文評選和演講比賽;城區小學生第二屆新樂教文藝匯演;城區小學生第二屆尚武大賽;城區小學生第三屆微機操作比賽和科技“三小”作品評選等總計十項活動。