第二，關於公務員管理機構。根據幹部管理的實際情況，公務員主管部門應當包括組織部門和人事部門。但是，在法律中直接寫黨委組織部，使黨的工作部門成為執法主體，在實際工作中面臨黨委組織部門要向人大報告工作並接受人大監督和司法監督的問題。因此，《公務員法》對這一問題作了技術處理，在法條中不出現黨委組織部門和政府人事部門的表述，將其統稱為“公務員主管部門”。第十條規定：“中央公務員主管部門負責全國公務員的綜合管理工作。縣級以上地方各級公務員主管部門負責本轄區內公務員的綜合管理工作。上級公務員主管部門指導下級公務員主管部門的公務員管理工作。各級公務員主管部門指導同級各機關的公務員管理工作”，這樣既避免了不必要的爭論，又為今後公務員管理留下了制度空間。在具體工作中，黨委組織部門和政府人事行政部門按照職責和許可權管理公務員事務。
關於雙重管理。雙重管理，是指上級業務主管部門黨組(黨委)和地方黨委按照幹部管理許可權，以一方為主、一方協助的方式，對有關部門、單位的領導班子和領導幹部實行共同管理。為主管理的部門或單位稱為主管方，協助管理的部門或單位稱為協管方。幹部雙重管理主要包括兩種類型，也可以說“2+1”。兩種類型為：一是以上級業務主管部門黨組(黨委)為主、地方黨委協助管理的，屬於這種管理類型的部門單位，基本都是業務上以上級主管部門領導為主或者是上級業務主管部門的直屬和派出機構；二是以地方黨委管理為主、上級業務主管部門黨組(黨委)協助管理的，屬於這種管理類型的部門單位，都是地方黨政機關、民眾團體。這兩種類型的幹部管理與業務領導體制基本一致。另外一種類型為，安全、地稅、工商、質量技術監督、藥品監督、國土資源6個部門實行省級機構以地方黨委管理為主、省級以下機構以上級業務主管部門黨組(黨委)管理為土的體制。
目前幹部雙重管理存在的主要問題有：一是數量多，分布廣。從中央部門的角度來看，黨中央部門、xx部門(議事協調機構和臨時機構除外)及中央一級人民團體系統中實行幹部雙重管理的約占40％，其中以中央有關部門黨組(黨委)管理為主的約占17％，以地方黨委管理為主的約占19％，省級機構以地方黨委管理為主、省級以下機構以上級業務主管部門黨組(黨委)管理為主的約占5％。從地方的角度來看，地方黨政機關實行幹部雙重管理的約占43％，基本以地方黨委管理為主。其中黨委工作部門，實行幹部雙重管理的約占60％；政府工作部門，實行幹部雙重管理的約占39％。二是缺乏統一規範。目前雙重管理依據的政策規定，散見於100多個單項性檔案中，條塊之間在幹部政策、待遇管理等方面存在較大差異，一定程度上導致了幹部管理
和政策上各自為政的分散局面。三是地方與部門在認識上存在著較大的分歧。造成這種認識分歧的深層原因，一方面在於一些地方和部門作為不同的利益主體，都站在自身的局部利益上說話，另一方面在於實行幹部雙重管理體制的指導思想還不明確，對為什麼要實行雙重管理、依據什麼原則和條件確定或變更幹部雙重管理體制缺少完整清晰、普遍認同的劃界標準。此外，由於現行的體制不能隨著形勢和任務的變化進行調整，導致幹部雙重管理“終身制”，幹部雙重管理部門只增不減，數量不斷增多，範圍逐漸擴大。四是幹部雙重管理工作中徵求意見的程式多、範圍廣、方式複雜，地方與部門溝通協調不夠，使得幹部任免周期長、摩擦多、效率低的問題比較普遍。由於幹部雙重管理體制還